Niklas Mustelin syntyi Helsingissä vuonna 1966. 6-vuotiaana hän aloitti pianotunteja ja 15-vuotiaana hän alkoi soittaa ammattimaisesti suomalaisten jazzmuusikoiden kuten Nalle Lindströmin kanssa.

Lukion jälkeen vuonna 1985 hän aloitti opinnot Helsingin Pop & Jazz Konservatoriossa. Kesällä 1993 Niklas suoritti esiintymistutkinnon Manhattan School of Musicissa New York Cityssä, NYC. Hänen opettajiaan olivat Harold Danko (piano) ja Harvie Swartz (basso). NYCissä hän soitti muun muassa Wynton Marsaliksen, Ralph Lalaman ja Ron McCluren kanssa.

Vuonna 1995 Niklas valmistui Helsingin Pop & Jazz Konservatoriosta musiikkiopettajan kandidaatiksi. Myöhemmin samana vuonna hän muutti Bostoniin, jossa hän opiskeli Berklee College of Musicissa ja valmistui vuonna 1997 ammattimusiikin kandidaatiksi keskittyen säveltämiseen, sovittamiseen ja esiintymiseen.

Niklas on opiskellut myös New England Conservatoryssa Bostonissa ja The Juilliard Schoolissa NYCissä.